Thiết kế Primer Hiệu quả với PerlPrimer
PerlPrimer là một ứng dụng GUI miễn phí, mã nguồn mở được thiết kế để thiết kế mồi hiệu quả cho nhiều ứng dụng PCR khác nhau, bao gồm PCR chuẩn, bisulphite và real-time PCR. Phần mềm tự động hóa quá trình thiết kế mồi, giúp người dùng dễ dàng sử dụng cho các nhà nghiên cứu trong lĩnh vực tin sinh học. Các tính năng chính bao gồm tính toán các mồi-dimer tiềm năng, truy xuất các chuỗi gen từ Ensembl, và khả năng thực hiện tìm kiếm BLAST trên các mồi. Kết quả có thể dễ dàng được lưu hoặc xuất ra định dạng phân tách bằng tab tương thích với hầu hết các ứng dụng bảng tính.
Ứng dụng cũng có các chức năng nâng cao như các thuật toán phát hiện ORF và đảo CpG, và khả năng thêm các chuỗi clon vào các mồi trong khi đảm bảo chúng vẫn ở dạng khung. Nó tính toán nhiệt độ nóng chảy với độ chính xác cao dựa trên các tham số nhiệt động học đã được thiết lập và cho phép người dùng tùy chỉnh các điều kiện PCR. PerlPrimer được thiết kế để tương thích đa nền tảng, hoạt động trên Windows, GNU/Linux và Mac OS X, làm cho nó trở thành một công cụ linh hoạt cho các nhà khoa học tham gia vào sinh học phân tử.